Die zweite große Gruppe von Orchideen hat eine besondere Form von Wurzeln, Rhizome genannt, als Speicherorgane. Die meisten von ihnen haben kriechende Rhizome, die Ableger bilden und viele Tochterpflanzen erzeugen können. Epipactis und Cypripedium gehören zu dieser Gruppe. Goodyera erzeugt Ausläufer über der Erdoberfläche, wie Erdbeerpflanzen. All diese Orchideen neigen dazu, bald große Kolonien zu bilden.
Einige Orchideen haben sehr seltsame Rhizome. Die verworrenen oder korallenförmigen Rhizome von Neottia, Corallorhiza und anderen sind echte Mykorhizome und gehören zu Orchideen die sehr von einem Pilz abhängig sind. Die seltsame Form dieser Rhizome hat wahrscheinlich den Sinn ihre Oberfläche zu vergrößern. Auch diese Orchideen können die Fähigkeit zur Bildung von Ablegern haben.
